绿色化工研究所是仲恺农业工程学院校级科研机构。绿色化工研究所主要研究与农业、工业、生态、环境保护、生物等学科相关的化学与化工过程的科学规律以及应用基础理论，开发出一系列新工艺、新技术、新产品，解决绿色化工过程中的关键技术问题，进一步发展与推广绿色化工技术，更好地为广东省以及周边地区的经济建设服务。
    绿色化工研究所科研实力雄厚，现有科研人员11人，其中教授（研究员）3人，副教授（高级工程师）7人，讲师1人，4人具有博士学位，5人在职攻读博士学位。目前，绿色化工研究所还与西北工业大学、广东工业大学、中国矿业大学联合培养博士研究生12人，硕士研究生5人。